一項空間科學衛星任務從建議提出到發射運行可分為六個階段，分別是戰略規劃階段、預先研究階段、背景型號階段、工程立項與研制階段、科學運行階段、科學產出評估。
其中，工程立項與研制階段對衛星項目的成敗發揮著至關重要的作用。因為，即便前期進行了大量的規劃、論證，深入的預先研究與背景型號研究，其最終的目標都是為了保證衛星的成功發射。
中國科學院國家空間科學中心作為空間科學衛星的工程總體，專門設立了空間科學工程管理中心（簡稱工程中心），對立項后的空間科學衛星工程進行研制管理和組織實施，履行空間科學衛星工程大總體職責，統籌協調衛星、運載火箭、發射場、測控、地面支撐和科學應用六大系統。
全生命周期管理
一般而言，衛星工程分為立項論證、方案、初樣、正樣、發射、在軌測試交付與總結評價等階段。
而衛星工程管理則覆蓋了從論證到衛星退役全過程有關活動的管理，主要包括綜合論證、工程立項、總體設計、系統協調、研制生產、發射測控、在軌測試、交付運行、總結評價、離軌處置等。因此，將工程中心比作一個“大管家”其實再合適不過了。
當一個衛星項目進入工程立項程序時，工程中心要組織對項目進行綜合論證，包括衛星工程的科學背景、科學目標、有效載荷配置以及工程初步方案和任務對六大系統的要求等；通過可行性綜合論證之后，便進入整個工程型號任務的方案階段，工程中心要密切跟蹤方案設計。如果方案設計可行，便轉入初樣階段。在初樣階段，工程中心主要負責通過協調各種資源，來支持衛星初樣階段的工作。
當然，工程中心的“眼里”不只有衛星系統。“我們需要統籌協調，因此不僅需要關注衛星，還需要關注地面支撐、科學應用等系統。”空間中心主任王赤告訴《科學新聞》。
因為科學衛星發射成功，并不是任務結束的標志�？茖W衛星發射之后的管理非常重要，需要持續跟蹤數據處理與應用過程，協助科學家團隊組織科學數據的分析與研究。為此，工程中心還專門成立了運行與成果管理部，以便統籌和推進科學衛星在軌運行、數據保障與成果管理等方面的工作，努力實現科學衛星產出的最大化。
與此同時，作為空間科學衛星工程的重要組成部分，運載火箭的選型工作也屬于工程中心的工作范疇。此外，聯系發射場、申請頻率與軌道、申請發射許可等工作都由工程中心負責。
在這個龐大的復雜系統工程中，作為名副其實的“大管家”，工程中心始終以科學目標為引領，不放過空間科學衛星工程管理中的任何一個環節，從信息管理到進度管理、從經費管理到質量管理，再到技術狀態管理，全力配合各方并努力協調，只為確�？茖W衛星重大原創性科學產出目標的最終實現。
“首席科學家+工程兩總”
作為我國系列科學衛星的主要研發單位和用戶單位，空間中心經過多年的摸索與實踐，探索出一條科學衛星體制機制創新之路，實行的科學衛星工程管理體制行之有效，得到了科學界、航天工程界和國際同行的高度認可。
“我們建立了首席科學家具有最終否決權的‘首席科學家+工程兩總’管理制度。首席科學家在我國體制上第一次真正進入了管理體系，這是我們在管理上的一大創新。”王赤表示。
長期以來，“兩條指揮線”（即工程總指揮、工程總設計師，一般稱為“工程兩總”）是我國航天工程不斷取得成功的法寶。空間科學先導專項（一期）在此基礎上，將“兩條指揮線”拓展為“首席科學家+工程兩總”制。
在“首席科學家+工程兩總”模式中，首席科學家和工程兩總的職責不同，分工明確。首席科學家在立項論證階段牽頭組織設立科學目標和有效載荷配置，在運行和應用階段牽頭組織科學數據分析和應用，確保重大科學產出；工程兩總在工程研制階段負責衛星的設計、研制和發射，確�？茖W目標的工程實現。二者地位同等重要，都是圍繞一個共同的科學目標協同工作。
“首席科學家+工程兩總”制賦予了首席科學家“一票否決權”，真正做到了讓首席科學家“有職有權”，避免了過去科學目標“就湯下面”、讓位于工程技術的情況再度發生，確保了科學成果的產出。
由于首席科學家的參與，有助于把科學目標這一核心要素快速滲透到衛星工程研制建設的各個層面、各個環節。與此同時，衛星工程兩總要經常就工程情況與首席科學家溝通，使首席科學家更好地掌握工程研制對科學目標的保障情況。因此，這樣的創新管理模式不僅沒有影響到衛星研制的效率，反而有利于工程向前推進。
對科學衛星而言，沒有質量的進度就意味著寶貴資源的浪費，而沒有進度的質量同樣意味著科學目標的犧牲。
為了保證科學目標的最終實現，工程中心將不斷創新工程管理模式，繼續著眼大局、抓住關鍵、擔當服務，以時不我待的緊迫感、責任感和使命感，助力空間科學先導專項（二期）的順利實施�！�